Le JFK 50 Mile relie Boonsboro à Williamsport en une seule ligne, à travers trois terrains bien distincts : sentier de montagne, chemin de halage plat, puis routes de campagne vallonnées. Le départ est donné à 6 h 30 devant l'Historic Boonsboro Inn.
La course commence par la plus longue montée continue de la journée, du centre de Boonsboro jusqu'au sommet de Lambs Knoll, sur l'Appalachian Trail dans le South Mountain State Park. Le sentier rocailleux redescend ensuite par Crampton Gap avant de rejoindre Weverton, où le parcours quitte l'Appalachian Trail.
S'ouvre alors la longue section plate du C&O Canal Towpath, dans le C&O Canal National Historical Park, le long du fleuve Potomac : des dizaines de kilomètres presque sans relief, avec Antietam Creek autour de la mi-course, puis un passage près de Ferry Hill.
Le tracé quitte le halage vers Horseshoe Bend, traverse Downsville puis rejoint les routes de campagne vallonnées jusqu'à l'arrivée à Williamsport, à la Springfield Middle School — sous une barrière horaire de 13 heures.
Chemins et lieux : © contributeurs OpenStreetMap. Altitudes mesurées sur le tracé.